TropGen-DB (1996-1997) Pays tropicaux

Création et mise à disposition sur Internet d'une base de données sur le génome des plantes tropicales

- Organisme de financement : Ministère de la Coopération
- Réalisation : CIRAD (laboratoire AGETROP et Unité centrale IST)
- Coût total : 500 000 FF
- Coût des services fournis : 500 000 FF

DESCRIPTION DU PROJET

Ce projet a pour objet de mettre à disposition sur Internet une base de données sur le génome de deux plantes : bananier et cacaoyer.

La première phase a permis de construire la base de données en utilisant le logiciel de gestion de bases de données "ACEDB" spécialement adapté à la gestion de ce type d'information. Les informations sur le génome ont été produites ou collectées par le laboratoire d'analyse du génome des espèces tropicales du CIRAD (AGETROP).

Ensuite une interface a été créée entre la base de données et le réseau WWW. Elle permet d'interroger les informations disponibles selon différentes approches : ressources génétiques, locus, cartographies, séquences, sondes, amorces RPC, enzymes de restriction, collections.

NATURE DU PROJET

Recherche ; réalisation d'une base de données ; Internet ;

TYPES DE SERVICES FOURNIS

Cette base de données est un outils performant à la disposition des laboratoires de biologie moléculaire :

Elle offre une description du génome de deux plantes tropicales avec une interface d'accès simple à mettre en oeuvre.

Elle permet de corréler des données de différents types et de natures diverses (identité moléculaire, description morphologique, photos ...)

Elle sert de centre d'accueil et de traitement pour de nouvelles données de recherches en agronomie et en biologie moléculaire.

PERSONNES

Disciplines : Biologie moléculaire, génétique, informatique, base de données.

Durée d'intervention : généticien 12 mois, informaticien 6 mois.